Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sema3bQ62177 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3bQ62177 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms