Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim27Q62158 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms