Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SspnQ62147 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SspnQ62147 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms