Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtafrQ62035 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtafrQ62035 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms