Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nell2Q61220 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nell2Q61220 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms