Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1Q61191 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc1Q61191 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc1Q61191 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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