Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc9a1Q61165 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc9a1Q61165 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms