Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinQ61043 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinQ61043 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NinQ61043 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinQ61043 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NinQ61043 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinQ61043 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinQ61043 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinQ61043 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinQ61043 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinQ61043 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NinQ61043 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NinQ61043 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinQ61043 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinQ61043 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinQ61043 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NinQ61043 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NinQ61043 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NinQ61043 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinQ61043 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinQ61043 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NinQ61043 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinQ61043 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinQ61043 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinQ61043 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NinQ61043 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NinQ61043 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NinQ61043 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms