Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scarb1Q61009 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarb1Q61009 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms