Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrkQ60976 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms