Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp4Q60972 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms