Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep250Q60952 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep250Q60952 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms