Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DbpQ60925 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DbpQ60925 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DbpQ60925 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms