Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Neurod1Q60867 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Neurod1Q60867 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms