Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot7Q60809 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot7Q60809 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot7Q60809 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms