Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2cQ60772 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdkn2cQ60772 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms