Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stxbp3Q60770 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stxbp3Q60770 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms