Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mkrn3Q60764 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mkrn3Q60764 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms