Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha1Q60750 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Epha1Q60750 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms