Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmelQ60696 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PmelQ60696 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms