Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf123Q5XPI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf123Q5XPI3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf123Q5XPI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf123Q5XPI3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms