Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Utp20Q5XG71 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp20Q5XG71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp20Q5XG71 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms