Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uimc1Q5U5Q9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uimc1Q5U5Q9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Uimc1Q5U5Q9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Uimc1Q5U5Q9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uimc1Q5U5Q9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uimc1Q5U5Q9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Uimc1Q5U5Q9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uimc1Q5U5Q9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Uimc1Q5U5Q9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Uimc1Q5U5Q9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uimc1Q5U5Q9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Uimc1Q5U5Q9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Uimc1Q5U5Q9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uimc1Q5U5Q9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uimc1Q5U5Q9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uimc1Q5U5Q9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Uimc1Q5U5Q9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Uimc1Q5U5Q9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uimc1Q5U5Q9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uimc1Q5U5Q9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Uimc1Q5U5Q9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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