Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf1Q5U4C3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf1Q5U4C3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf1Q5U4C3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms