Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdcp1Q5U462 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdcp1Q5U462 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms