Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NotoQ5TIS6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NotoQ5TIS6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms