Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med13Q5SWW4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med13Q5SWW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms