Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
NacadQ5SWP3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NacadQ5SWP3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NacadQ5SWP3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NacadQ5SWP3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms