Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tns3Q5SSZ5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tns3Q5SSZ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tns3Q5SSZ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tns3Q5SSZ5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tns3Q5SSZ5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tns3Q5SSZ5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms