Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TefmQ5SSK3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TefmQ5SSK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms