Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Utp18Q5SSI6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Utp18Q5SSI6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms