Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf12Q5SPL2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf12Q5SPL2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf12Q5SPL2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf12Q5SPL2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf12Q5SPL2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf12Q5SPL2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf12Q5SPL2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms