Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms