Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5431Q5NCB3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5431Q5NCB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms