Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CoblQ5NBX1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CoblQ5NBX1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CoblQ5NBX1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms