Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnni3kQ5GIG6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnni3kQ5GIG6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms