Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Znf354cQ571J5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf354cQ571J5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms