Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf608Q56A10 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Znf608Q56A10 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf608Q56A10 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms