Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmtc2Q56A06 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmtc2Q56A06 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmtc2Q56A06 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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