Protein–RNA interactions for Protein: Q569Z6

Thrap3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thrap3Q569Z6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thrap3Q569Z6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thrap3Q569Z6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms