Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Spire1Q52KF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms