Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shank3Q4ACU6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms