Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brinp3Q499E0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brinp3Q499E0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms