Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snx25Q3ZT31 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms