Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp48Q3V0C5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp48Q3V0C5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp48Q3V0C5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms