Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaaf3Q3UYV8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms