Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf48Q3US17 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms