Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elf3Q3UPW2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms