Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam198bQ3UPI1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam198bQ3UPI1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam198bQ3UPI1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms