Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem253Q3UNB8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem253Q3UNB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms